Los aspectos positivos y negativos del primer Presidente de la República del Ecuador Juan José Flores fueron:
Aspectos positivos
.- La promulgación de la primera Constitución de la República.
.- La inserción de las islas Galápagos, el 12 de febrero de 1832 al Ecuador.
.- La creación de varias leyes sobre la moneda.
.- El reconocimiento de la deuda externa gran colombiana también llamada Deuda Inglesa adquirida por Colombia, Venezuela y Ecuador para respaldar la independencia.
.- Dio impulso a la política exterior.
.- La integración por decreto del Departamento del Cauca el 7 de octubre de 1831.
.- Firma del tratado de Pando-Noboa con el Perú.
.- Firma del tratado de Paz con Colombia.
Aspectos negativos
.- Durante su gobierno enfrentó alzamientos propiciados por políticos, militares descontentos, bandoleros y líderes populares urbanos.
.- Malversación de la renta nacional.
.- La fuerte presencia y poder de los militares extranjeros que exacerbó el "nacionalismo" de los notables guayaquileños.
.- Decreto de un nuevo impuesto general exceptuando a indios y esclavos, que generó una encendida oposición y alzamientos en contra de su gobierno.
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