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Mejor respuesta - elegida por quien preguntó
La respuesta de la usuario "nena" en parte es cierta.
El latín es la lengua designada para clasificar y nombrar a las especies taxonómicas.
Pero hay 2 razones por las cuáles se utiliza el latín para la nomenclatura binomial:
1.- Razón conciliatoria: Para un mismo animal o una misma planta, tenían diversos nombres para llamarla. Por ejemplo al perro le dicen chucho, pero sabemos que es Canis lupus familiaris (ya se clasificó como una subespecie del lobo). Entonces decidieron utilizar una LENGUA MUERTA, dado que no está sujeta a cambios en sus palabras conforme al tiempo (al contrario de lo que ocurre en las lenguas vivas, con sus modismos, regionalismos, etc.). Si le decimos perro o can a un chino, no sabrá de qué animal se trata, pero si le decimos Canis lupus familiaris, y si tiene nociones de nombres científicos, entonces sabrá que se trata del perro.
2.- Razón histórica: Recordemos que Carl von Linnaeus era un arraigado creyente, y la Iglesia Católica ejercía en ese tiempo una fuerte presión en los grupos intelectuales de la época europea. Las misas se daban en latín, lengua oficial de la Iglesia (gracias al imperio Romano). Entonces decidieron usar esa lengua oficial de la Iglesia para designar los nombres de las criaturas de la "creación" (soy anticreacionista, por eso pongo creación entre comillas).
Espero que te haya servido... XD