EL REAL Y SUPREMO CONSEJO DE LAS INDIAS, Surgió como un organismo que asesoraba al Rey en el gobierno de las colonias en América, la cual tenía la facultad de preparar las Reales Cédulas y Reales Ordenes, que una vez aprobadas por el Rey, eran aplicadas en las colonias, es decir tenía atribuciones políticas. Por otro lado existía LA CASA DE CONTRATACION, que se encargaba de controlar todas las actividades económicas y comerciales entre España y sus colonias americanas, sin embargo el Consejo de Indias ejercía mayor poder y tenía mayor categoría. En resumen, las autoridades en España eran dos: el Rey de España y el Consejo de Indias
EL VIRREY.- Era la primera autoridad que instituyeron los reyes en América y su representante directo. Entre sus principales funciones destacan la de presidir la Real Audiencia, dictaba leyes y ordenanzas, dando cuenta de ello al Consejo de Indias; era el jefe supremo de las fuerzas militares y navales; como Superintendente de la Real Hacienda controlaba todos los ingresos y egresos del Tesoro Real y la acuñación de monedas; ejercía el Vicepatronato de la Iglesia Católica, por lo que intervenía en el nombramiento de cargos religiosos de menor jerarquía. En conclusión al Virrey le correspondía "todo lo que el Rey hiciere en caso de estar presente".
LA REAL AUDIENCIA.- Constituida por los Oidores, cumplía funciones de carácter de gobierno o político y judicial, que compartía el ejercicio del gobierno con el Virrey y además asumía el gobierno por ausencia, incapacidad o muerte de éste.
LOS CORREGIMIENTOS.- Las diferentes provincias del virreinato estaban presididas y administradas por los Corregidores que tenían facultades POLITICAS (conservar el orden y la buena marcha de su Corregimiento), ECONOMICAS (cobraba el tributo de los indios), y JUDICIALES (hacer cumplir las leyes y resolvía los pleitos de los indígenas).
EL CABILDO.- Eran organismos que se ocupaban del gobierno y administración de las ciudades o centros urbanos (Municipales en la actualidad) y que estaban formados por dos Alcaldes y varios Regidores. Existieron dos tipos de estas instituciones: a) El Cabildo Español y b) Cabildo de Naturales. En los Cabildos de los Españoles, el cargo de Alcalde era designado por la Corona en recompensa por algún servicio, o comprado, ya que la Corona siempre necesitada de rentas.
LAS INTENDENCIAS.- Creadas en lugar de los Corregimientos, después de la gran revolución de Túpac Amaru II, la cual estuvo a cargo del Intendente que tenía más atribuciones que el corregidor pero menos privilegios y era un pequeño Virrey en su Intendencia.
